Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms