Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Trim71Q1PSW8 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 424.8 ms