Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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ptchd1Q14B62 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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ptchd1Q14B62 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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ptchd1Q14B62 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ptchd1Q14B62 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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