Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd1Q01822 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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