Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RabggtbP53612 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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