Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms