Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PtprmP28828 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PtprmP28828 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PtprmP28828 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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