Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Hoxd12P23812 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd12P23812 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms