Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Nedd9O35177 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Nedd9O35177 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Nedd9O35177 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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