Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn34c3J3QJW5 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 387.9 ms