Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Gm20538F6Z9R1 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms