Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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Pdzd2E9Q1M1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Pdzd2E9Q1M1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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Pdzd2E9Q1M1 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Pdzd2E9Q1M1 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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Pdzd2E9Q1M1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Mirlet7b-201ENSMUST00000083630 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Pdzd2E9Q1M1 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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