Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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Zfp558E9Q1J0 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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Zfp558E9Q1J0 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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Zfp558E9Q1J0 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms