Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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