Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cln8Q9QUK3 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cln8Q9QUK3 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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