Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms