Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Ccdc47Q9D024 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccdc47Q9D024 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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