Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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