Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rprd1bQ9CSU0 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rprd1bQ9CSU0 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rprd1bQ9CSU0 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rprd1bQ9CSU0 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms