Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Apobec3Q99J72 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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