Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cldn16Q925N4 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 342 ms