Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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Gm20809Q62458 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Gm20809Q62458 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Gm20809Q62458 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Gm20809Q62458 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Gm20809Q62458 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Gm20809Q62458 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms