Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Hoxa13Q62424 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Hoxa13Q62424 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms