Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Rbbp4Q60972 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Rbbp4Q60972 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Rbbp4Q60972 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Rbbp4Q60972 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Rbbp4Q60972 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms