Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Sft2d1Q5SSN7 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm43432-201ENSMUST00000196352 121 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms