Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Usp19Q3UJD6 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms