Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Q3U6N9 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Q3U6N9 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Q3U6N9 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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