Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Trim71Q1PSW8 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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