Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ptchd1Q14B62 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms