Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RabggtbP53612 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RabggtbP53612 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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