Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
Rpl28P41105 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Rpl28P41105 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms