Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RxraP28700 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RxraP28700 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RxraP28700 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RxraP28700 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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