Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CntfrO88507 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
CntfrO88507 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CntfrO88507 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms