Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Tnnt1O88346 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Tnnt1O88346 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Tnnt1O88346 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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