Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Pdzd2E9Q1M1 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms