Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Zfp558E9Q1J0 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Zfp558E9Q1J0 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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