Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Spocd1B1ASB6 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms