Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Grik3B1AS29 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Grik3B1AS29 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms