Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Knop1Q9Z2Q2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Knop1Q9Z2Q2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms