Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mbd1Q9Z2E2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms