Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tulp1Q9Z273 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms