Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lgr5Q9Z1P4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lgr5Q9Z1P4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms