Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms