Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms