Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpv2Q9WTR1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms