Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PplQ9R269 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms