Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms