Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf4Q9QZS2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms