Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas3Q9QZQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms