Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp21Q9QZL6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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